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遗传研究室简介
时间:2022-04-15


首都儿科研究所遗传研究室于1981年建立,于2004年正式成立,宋昉研究员任首任科室主任。遗传研究室于2016年重新组建,中国工程院院士张学教授兼任科室主任,宋昉研究员任遗传学科首席专家,遗传学科进一步扩展,形成了3个研究方向的课题组(宋昉、陈晓丽、姜茜)。遗传研究室于2018年荣获北京市医院管理局职工科技创新工场培育团队称号,宋昉任创新工场负责人;2007年和2019年两次荣获首都儿科研究所先进集体称号。

宋昉课题组简介

宋昉课题组于2004年组建,是遗传研究室最早组建的课题组,课题组长宋昉研究员是遗传研究室首任科室主任和首席专家。现有科研人员5名,其中研究员2名,副研究员1名,副主任技师1名,主管技师1名,硕士生导师3名。

宋昉课题组的研究方向为儿童遗传病的致病机制、队列研究、基因诊断和治疗等基础研究,同时,开展转化医学的临床服务。

宋昉课题组是我国儿科领域最早开展儿童遗传病研究和基因诊断的科研团队,从上世纪80年代的细胞遗传学和分子遗传学、进入到本世纪的基因组医学。团队秉承基础研究结合临床应用的研究方向,研究和诊断的遗传病病种达到70余种。建立了5000余例多种遗传病患者的临床队列、生物样本库和突变数据库。在致死性罕见病-脊髓性肌萎缩症进行了致病机制、修饰机制、突变图谱、自然病史、临床队列等一系列创新研究,获得了多项代表中国患者的研究数据,处于国内领先、国际先进水平。通过成果的转化应用,以及科普宣传和公益活动,积极推进了国内SMA的行业发展,获得显著社会效益。先后获得7项科学技术奖和学术成果。

1. 课题:

① 十三五重点研发项目“罕见病临床队列研究”:子课题“脊髓性肌萎缩症注册登记研究”,宋昉,72万,2017.01-2021.12;

② 国家自然科学基金面上项目:致SMN1基因Pre-mRNA异常剪接和mRNA降解的致病机制及姜黄素修正作用的研究(81470056),宋昉,30万,2015.01-2016.12

③ 国自然基金委青年基金项目:从干扰snRNP组装活性探讨SMN1基因无义突变p.Glu14X的致病机制,曹延延22.8万,2016.1-2018.12

④ 国自然基金委青年基金项目:SMN1基因p.Y109C和p.Y277C新突变影响SMN蛋白磷酸化调控致SMA发病的机制研究,白晋丽21.6万,2016.1-2018.12

⑤ 国自然基金委青年基金项目:SMN1基因p.Arg288Met (c.863G>T)错义突变干扰外显子7 正确剪接的机制研究(81100933),瞿宇晋,23万,2012.01-2014.12

⑥ 国家自然科学基金主任基金项目:基因组遗传背景与DNA甲基化对脊肌萎缩症表型的影响(81050034),宋昉,15万,2011.01-2011.12

⑦ 北京市自然面上项目:SMN2基因启动子区新治疗靶点反义寡核苷酸的筛查及基于SMA模型鼠的干预研究,瞿宇晋,20万,2021.01-2023.12

⑧ 北京市自然面上项目:精准靶向SMN新顺式作用元件的反义寡核苷酸在SMA病人细胞系和模型鼠中的作用,瞿宇晋,20万,2017.01-2019.12

⑨ 北京市自然面上项目:SMA复合杂合突变机制和新突变对蛋白功能影响的研究(7112020),宋昉,11万,2011.01-2013.12

⑩ 北京市自然科学基金项目:中国人苯丙氨酸羟化酶基因新突变的功能表达研究(5052008)

? 北京市自然科学基金预探索项目:SMN1基因邻近翻译起始点的无义突变抵抗NMD机制初探(5163028),曹延延,6万,2016.01-2017.12

? 第63批中国博士后科学基金面上项目:新致病基因WDR90的机制初探,曹延延8万,2018.06-2019.12;

? 北京市委组织部:通读诱导剂补救SMN1 基因点突变导致mRNA 降解的研究,曹延延5万,2015.1-2017.12

? 首都卫生发展科研专项:脊髓性肌萎缩症基因诊断技术的建立、评价和应用(2011-1008-03),宋昉,40万,2012.06-2015.05

? 北京市医管局青苗计划项目:SMA点突变临床基因诊断策略的优化,白晋丽12万,2017.01-2018.12

? 首儿所方向引导基金:ASOs屏蔽SMN2甲基化位点及新顺式作用元件对调控 FL-SMN2转录的作用初探,瞿宇晋10万,2017.01-2018.12

? 首儿所方向引导基金:SMN1基因YG结构域新错意突变的致病机制研究,白晋丽,8万,2020.01-2021.12

2. 奖项

① 2019年中华医学科技奖三等奖:“儿童脊髓性肌萎缩症的分子遗传学和精准诊断体系的创新研究和应用”,第一完成单位:首都儿科研究所,完成人:宋昉、瞿宇晋、白晋丽、曹延延、葛绣山、金煜炜、王红、陈倩、王立文、邹丽萍、李尔珍、杨艳玲、王旭、吕岩玉、张文慧;

② 2019年中国医院协会医院科技创新奖二等奖:“儿童脊髓性肌萎缩症的分子遗传学和精准诊断体系的创新研究和应用”, 第一完成单位:首都儿科研究所,完成人:宋昉、瞿宇晋、白晋丽、曹延延、葛绣山、彭晓音、张文慧、金煜炜、王红、李尔珍、王立文、吕岩玉、陈倩、朱彦丽;

③ 2019年华夏医学科技奖三等奖 :“儿童脊髓性肌萎缩症的分子遗传学和精准诊断体系的创新研究和应用”,第一完成单位:首都儿科研究所,完成人:宋昉、瞿宇晋、曹延延、白晋丽、葛绣山、彭晓音、金煜炜、王红、陈倩、张文慧、李尔珍、王立文、朱彦丽、吕岩玉;

④ 2021 第四届中国出生缺陷干预救助基金会科技成果奖二等奖:“常见儿童神经系统遗传病的分子遗传学研究和基因诊断技术的创新及应用”第一完成单位:首都儿科研究所,完成人:宋昉, 瞿宇晋, 曹延延, 白晋丽,金煜炜, 王红;

⑤ 2018年北京医学科技奖三等奖:“儿童脊髓性肌萎缩症的自然史、分子遗传学和基因诊断研究”, 第一完成单位:首都儿科研究所,完成人:宋昉、瞿宇晋、曹延延、白晋丽、葛绣山、金煜炜、王红;

⑥ 2010 新疆维吾尔自治区科学技术进步奖 新疆地区苯丙酮尿症筛查、治疗及基因研究 二等奖 宋昉(排名第五)证书号G20100516 颁奖机构 新疆维吾尔自治区人民政府 2011.01.11

⑦ 1997 北京市科学技术进步奖 苯酮尿症基因诊断的研究与应用 三等奖 宋昉(排名第一)证书号 No.1颁奖机构 北京市科学技术进步奖评审委员会 1997.03

3. 文章

① Peng X, Qu Y, Li X, Liu J, Shan X, Wang J, Song F. Bone mineral density and its influencing factors in Chinese children with spinal muscular atrophy types 2 and 3. BMC Musculoskelet Disord. 2021 Aug 24;22(1):729. doi: 10.1186/s12891-021-04613-x. PMID: 34429096; PMCID: PMC8386040.

② Cao Y, Cheng M, Qu Y, Bai J, Peng X, Ge X, Jin Y, Wang H, Song F*.Factors associated with delayed diagnosis of spinal muscular atrophy in China and changes in diagnostic delay. Neuromuscul Disord. 2021 Mar 6:S0960-8966(21)00066-3.

③ Bai J, Qu Y, Song F,* Cao Y, Cheng M, Wang J, Jin Y, Wang H.Dual Mechanism of a New SMN1 Variant (c.835G>C, p.Gly279Arg) by Interrupting Exon 7 Skipping and YG Oligomerization in Causation of Spinal Muscular Atrophy. The Journal of Molecular Neuroscience.2021 Jan;71(1):112-121.

④ Yanyan Cao, Yujin Qu, Jinli Bai, Miaomiao Cheng, Yuwei Jin, Hong Wang, Fang Song*. Transmission characteristics of SMN from 227 spinal muscular atrophy core families in China. Journal of Human genetics.2020.Published online. doi.org/10.1038/s10038-020-0730-1.

⑤ YanYan Cao,Zhang WH, YuJinQu,JinLiBai,YuWei Jin, Hong Wang, Fang Song *.Diagnosis of Spinal Muscular Atrophy: A Simple Method for Quantifying the Relative Amount of Survival Motor Neuron Gene 1/2 Using Sanger DNA Sequencing Chin Med J (Engl),2018.131(24): 2921–2929.

⑥ Bai JL, Qu YJ, Cao, YY; Yang L,Ge L,Jin, YW; Wang, H; Hong Wang,Song, F*.The SMN1 common variant c.22 dupA in Chinese patients causes spinal muscular atrophy by nonsense-mediated mRNA decay in humans,Gene;2018,644:49-55

⑦ Qu, YJ; Ge, L; Bai, JL; Cao, YY; Jin, YW; Wang, H; Yang, L; Song, F*. 2017. p.Vall9Glyfs*21 and p.Leu228*variants in the survival of motor neuron 1 trigger nonsense-mediated mRNA decay causing the SMN1 PTC + transcripts degradation. MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS, 806:31-38.

⑧ Bai JL, Jin YW, Qu YJ, Wang H, Cao YY, Song F*. Mosaicism of Tetrasomy 18p: Clinical and Cytogenetic Findings in a Female Child. Chin Med J (Engl). 2017 Mar 20;130(6):744-746.

⑨ Qu, YJ; Bai, JL; Cao, YY; Wang, H; Jin, YW; Du, J; Ge, XS; Zhang, WH; Li, Y; He, SX; Song, F*. Mutation Spectrum of the Survival of Motor Neuron 1 and Functional Analysis of Variants in Chinese Spinal Muscular Atrophy. JOURNAL OF MOLECULAR DIAGNOSTICS, 2016. 18(5):741-752.

⑩ Qu, YJ; Bai, JL; Cao, YY; Zhang, WH; Wang, H; Jin, YW; Song, F*. A rare variant (c.863G > T) in exon 7 of SMN1 disrupts mRNA splicing and is responsible for spinal muscular atrophy. EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS,2016. 24(6):864-870.

? Cao, YY; Qu, YJ; He, SX; Li, Y; Bai, JL; Jin, YW; Wang, H; Song, F*. Association between SMN2 methylation and disease severity in Chinese children with spinal muscular atrophy. JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY-SCIENCE B,2016. 17(1):76-82.

? Bai JL#, Qu YJ#, Cao Y, Li Y, Zhang W, Jin Y, Wang H, Song F*. X-linked ichthyosis and Crigler-Najjar syndrome Ⅰ: Coexistence in a male patient with two copy number variable regions of 2q37.1 and Xp22.3. Mol Med Rep.2016 Feb;13(2):1135-40.

? Qu, YJ; Ge, XS; Bai, JL; Wang, LW; Cao, YY; Lu, YY; Jin, YW; Wang, H; Song, F*. Association of Copy Numbers of Survival Motor Neuron Gene 2 and Neuronal Apoptosis Inhibitory Protein Gene With the Natural History in a Chinese Spinal Muscular Atrophy Cohort. JOURNAL OF CHILD NEUROLOGY, 2015.30(4):429-436.  

? Yanyan Cao, Yujin Qu, Fang Song*, et al. Fast clinical molecular diagnosis of hyperphenylalaninemia using next-generation sequencing-based on a custom AmpliSeq? panel and Ion Torrent PGM sequencing (2014). Mol Genet Metab. 113(4): 261-266.

? Cao, YY; Qu, YJ; Bai, JL; Jin, YW; Wang, H; Song, F*. Correlation of PLS3 expression with disease severity in children with spinal muscular atrophy. JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 2014. 59(1):24-27.

? Bai, JL; Qu, YJ; Cao, YY; Li, EZ; Wang, LW; Li, Y; Zhu, YL; Zhang, WH; Jin, YW; Wang, H; Song, F*. Subtle Mutation Detection of SMN1 Gene in Chinese Spinal Muscular Atrophy Patients: Implication of Molecular Diagnostic Procedure for SMN1 Gene Mutations. GENETIC TESTING AND MOLECULAR BIOMARKERS, 2014.18(8):546-551.

? Bai, JL; Qu, YJ; Jin, YW; Wang, H; Yang YL; Jiang YW, Yang XY, Zou LP, Song, F*. Molecular and clinical characterization of Angelman Syndrome in Chinese patients. Clin Genet. 2014 Mar; 85(3):273-277.

? Ge, XS; Bai, JL; Lu, YY; Qu, YJ; Song, F*. The Natural History of Infant Spinal Muscular Atrophy in China: A Study of 237 Patients. JOURNAL OF CHILD NEUROLOGY, 2012.27(4):471-477.

? Qu, YJ; Du, J; Li, EZ; Bai, JL; Jin, YW; Wang, H; Song, F*. Subtle mutations in the SMN1 gene in Chinese patients with SMA: p.Arg288Met mutation causing SMN1 transcript exclusion of exon7. BMC MEDICAL GENETICS,2012. 13():86.

? CAO Yan-yan, ZHANG yan-ling, DU Juan, et al Compound mutations (R237X and L375P) in the Fumarylacetoacetate Hydrolase gene causing tyrosinemia type I in a Chinese patient。 Chinese medical journal 2012;125(12):2132-2136

21 Qu, YJ; Song, F; Yang, YL; Jin, YW; Bai, JL. Compound heterozygous mutation in two unrelated cases of Chinese spinal muscular atrophy patients. CHINESE MEDICAL JOURNAL, 2011. 124(3):385-389.

22 Bai, JL; Qu, YJ; Jin, YW; Song, F*. A novel missense mutation of the Ubiquitin protein ligase E3A gene in a patient with Angelman syndrome. Chinese medical journal 2011;124(1):84-88

23 白晋丽,瞿宇晋,宋昉,曹延延,贾妮,王嘉,金煜炜,王红. 基于脊髓性肌萎缩症注册队列人群的基因诊断技术应用调查分析[J].中华检验医学杂志,2021,44(8):743-748.

24 王嘉 瞿宇晋.反义寡核苷酸治疗在神经退行性疾病中的应用[J].国际儿科学杂志,2020, 47(5):297-301.

25 程苗苗,曹延延.NMD逃逸机制及其在疾病治疗中的应用[J].遗传,2020,42(4):354-362.

26 瞿宇晋,田亚林,宋昉,王嘉,白晋丽,曹延延,金煜伟,王红,程苗苗.脊髓性肌萎缩症患儿免疫规划疫苗接种率及不良反应调查[J].中华儿科杂志,2020,58(4):308-313.

27 葛绣山,瞿宇晋,彭晓音,陈倩,焦辉,宋昉. 综合健康管理对Ⅰ型脊髓性肌萎缩患儿预后的影响[J]. 中华儿科杂志,2020,58(5):398-402. 彭晓音,瞿宇晋,宋昉等. COL6A3基因变异所致Ⅵ型胶原蛋白缺乏相关肌病的临床与遗传学分析;中华儿科杂志, 2019,57(2);136-141

28 杨兰,宋昉.脊髓性肌萎缩症的治疗研究进展.中华儿科杂志, 2016, 54(8), 634-637

29 曹延延, 瞿宇晋, 宋昉, 等. 应用二代测序平台筛查高苯丙氨酸血症相关基因突变 (2015). 中华医学遗传学杂志. 32(1): 16-20.

30 白晋丽,瞿宇晋,李尔珍,金煜炜,曹延延,王红,宋昉.运动神经元存活基因1点突变的鉴定及其对全长运动神经元存活基因1转录表达的影响.中华神经科杂志, 2013.46(2):100-106,

31 曹延延,瞿宇晋,宋昉, 等.应用基因组测序技术诊断缺失型脊肌萎缩症.中华医学遗传学杂志,2013,30(4):410-414.

32 金煜炜,瞿宇晋,王红, 等.PCR-RFLP法在脊髓性肌萎缩症基因检测中的局限性.中华医学遗传学杂志,2012,29(1):34-37.

33 瞿宇晋,都娟,李尔珍, 等.脊髓性肌萎缩症的SMN1基因点突变分析.中华医学遗传学杂志,2011,28(2):121-126.

34 贺圣晰,葛绣山,瞿宇晋,金煜炜,王红,白晋丽,宋昉.脊髓性肌萎缩症患儿中运动神经元生存基因转化的遗传分析.中华医学遗传学杂志, 2011, 28(6), 606-610

35 白晋丽,宋昉,邹丽萍,杨欣英,瞿宇晋,王立文,杨艳玲,金煜炜,王红.15q11-13缺失型Angelman综合征17例遗传学诊断及临床特点。中华儿科杂志,2010.48(12):939-943,

36 白晋丽, 王红, 杨艳玲, 宋昉. 1例由染色体不平衡易位t(5;15)导致的Prader-Willi 综合征,中华医学遗传学杂志, 2010.27(6),664-667

4. 著作、共识

① 宋昉副主编。“罕见病诊疗指南(2019版)”.人民卫生出版社,ISBN 978-117-28668-8.主编张抒扬,副主编陈丽萌、宋昉、徐凯锋、朱以诚、吴志宏

② 宋昉,瞿宇晋,曹延延,白晋丽(编委)。中国第一批罕见病目录释义[M],北京:人民卫生出版社, ISBN 978-7-117-27579-8。

③ 宋昉第一通讯作者.北京医学会医学遗传学分会,北京罕见病诊疗与保障学会.脊髓性肌萎缩症遗传学诊断专家共识[J].中华医学杂志,2020,100(40):3130-3140.

④ 宋昉共同通讯作者.脊髓性肌萎缩症多学科管理专家共识.中华医学杂志,2019,99(19):1460-1467.

5. 国家发明专利

① 国家发明专利 一株用于验证脊肌萎缩症的永生淋巴细胞株 发明人 宋昉,白晋丽,瞿宇晋,曹延延,金煜炜,王红 专利号 ZL 2017 1 1149033.2

6. 成果转化

遗传室注重科研成果转化,在临床服务方面呈现了符合现代疾病谱变化,满足临床需求的服务意识和实践技能。

① 建立了分子遗传、细胞遗传和基因组学的联合检测平台,转化诊断技术12项。

② 申报发明和应用专利4项。

③ 开展临床检测、遗传咨询、产前诊断转诊等临床服务。

④ 开展各类公益活动宣传遗传病科普知识,助力患者的医疗干预和救助。

承担北京市科委硕士研究生培养和教学工作。共培养硕士研究生11名,联合培养硕士博士生和研究生3名。

陈晓丽课题组简介

陈晓丽课题组现有科研人员3名,高级职称2名,中级职称1名,博士研究生导师1名.

陈晓丽课题组主要研究儿童出生缺陷、神经发育障碍的遗传基础。擅长儿童神经发育障碍性疾患(智力迟滞/发育迟缓,孤独症谱系障碍,语言障碍,学习困难)的遗传诊断和致病机理基础研究。利用高通量基因组技术结合流行病学、常规分子生物学技术和iPS细胞、动物的基因编辑模式,研究儿童神经发育障碍的遗传基础和靶向治疗。

陈晓丽课题组主持15个国家/北京市自然基金、北京科委和医管局等项目。2014年入选北京市百千万工程领军人才,2014年入选北京市卫生系统215高层次人才“学术骨干”称号,2015年入选北京市高创人才计划领军人才(G01050004)。参与文章发表53篇(第一/通讯作者为26篇),其中SCI文章33篇(第一/通讯作者为18篇),IF最高为70.67(New England Journal of Medicine, The American Journal of Human Genetics, Genetics In Medicine,Human Mutation)。拥有国家级发明专利1个。参与多个项目获得国家级自然科学奖一等奖。培养博士研究生2名,硕士研究生1名。

姜茜课题组简介

姜茜课题组现有科研人员2名,其中高级职称科研人员1名,中级职称科研人员1名,硕士生导师1名。

姜茜课题组主要研究方向为儿童消化道先天发育异常性疾病的分子遗传学发病机制研究及遗传咨询,包括先天性巨结肠、Currarino综合征、先天性短肠综合征、慢性假性肠梗阻、肛门闭锁等;形成由遗传室、普外科、病理科、影像科、超声科正式在职人员组成的多学科研究团队,全方位实施针对不同疾病的诊断、治疗、随访、保健、发病机制等系列研究特色。

课题组PI姜茜研究员作为项目负责人先后承担国家自然基金项目3项,北京市自然科学基金面上项目1项,北京市科技新星项目2项;作为项目骨干参加北京市医管局“登峰”人才培养计划1项,北京市自然科学基金青年项目1项。参与获得省部级以上科技奖励二等奖2项(2018, 2019)。共发表SCI收录论文26篇,累计影响因子135,其中通讯或共同通讯作者论文9篇(Gastroenterology、Genet Med、Mol Cell Proteomics、Orphanet J Rare Dis、Front Genet、Sci Rep、G3 (Bethesda)、Mol Cytogenet)。获得国家发明专利授权2项(第一发明人、第二发明人各1项)。截至2021年7月,已毕业硕士研究生1名、在研2名。